Das Präsidium von Eintracht Frankfurt setzt sich zusammen aus dem Vereinspräsidenten und derzeit fünf Vizepräsidenten. Der Präsident wird von der Mitgliederversammlung auf Vorschlag des Verwaltungsrates und des Wahlausschusses für eine Legislaturperiode von vier Jahren gewählt. Auf Vorschlag des Präsidenten werden die übrigen Präsidiumsmitglieder für den gleichen Zeitraum bestellt.

Die Aufgaben des Präsidiums sind folgendermßen gegliedert:

Das Gremium ist berechtigt und verpflichtet, alle Maßnahmen zu ergreifen, die für eine ordnungsgemäße Vereinsführung erforderlich sind. Das Präsidium hat per Geschäftsordnung folgende Zuständigkeiten festgelegt: Präsident Peter Fischer repräsentiert das Präsidium und den Verein gegenüber der Öffentlichkeit, insbesondere im Verkehr mit Behörden, Verbänden, Wirtschaftsorganisationen und Medien. Er ist zudem verantwortlich für neue Geschäftsfelder, Strategie und das Nachwuchsleistungszentrum. Vizepräsident Dieter Burkert verantwortet den Amateur-, Nachwuchs- und Seniorensport sowie die Bereiche Mitgliederwesen und Vereinsorganisation. Für den Finanzbereich ist Vizepräsident Thomas Förster als Schatzmeister des Vereins zuständig, ebenso für das Rechnungswesen und das Management der Beteiligungen. Vizepräsident Michael Otto obliegen die Bereiche Einkauf, CSR, IT und Liegenschaften. Für die Fan- und Förderabteilung und für juristische Angelegenheiten des Vereins ist Vizepräsident Stefan Minden zuständig. Personal, Marketing und Kommunikation gehören zum Zuständigkeitsbereich von Moritz Theimann.